Репатриантка помогает медикам из Гарварда – и разрабатывает в Израиле лекарство от рака

Мария Дьякова – новая репатриантка и биоинформатик. В Израиле она участвует в разработке лекарства от рака. А также сотрудничает с Гарвардом, как бы ни протестовали в поддержку ХАМАСа тамошние студенты. Она рассказала «Деталям», как искусственный интеллект может спасать жизни, почему она рада, что оказалась в Израиле во время войны. И почему не надо идти на курсы хайтек-профессий.

В «черную субботу» Мария Дьякова с сыном были в отпуске. Они летели домой в один из первых тяжелых дней, войны, с постоянными обстрелами из Газы.

«Помню из иллюминатора я видела ракеты, видела, как их сбивают. И несмотря на это было такое чувство, что мы летим домой», — вспоминает Мария.

Именно в те дни она окончательно почувствовала это. Дьяковы думали о репатриации давно, но уехали раньше запланированного – сразу после полномасштабного вторжения РФ  в Украину. Одна война заставила ее покинуть Россию, другая – ощутить себя частью Израиля.

«Моя главная задача сейчас – продолжать развивать медицинский проект, в котором мы ищем лекарство от рака. В том числе и потому, что он повышает значение Израиля в мире, — объясняет она. — Каждый раз, когда мы выходим на связь с нашими европейскими коллегами, они видят, что Израиль — это демократическая цивилизованная страна, в которой есть ученые и интересные проекты».

• Читайте также: 
• «Учу иврит, охраняя мошав». Как репатриантка-ученая с мировым именем среди войны нашла свой дом в Израиле
• Профессор на Ливанской войне. Удивительная судьба Виталия Мильмана — лауреата Премии Израиля
• Билет в один конец для израильского олимпийского тренера

ИИ против рака

В России Мария работала в IT на хорошей позиции. Она была дата-cайентистом – человеком, который пишет и обучает нейросети и другие модели искусственного интеллекта. Своя команда, зарплата такая же как в Израиле, но при российских ценах. Однако  только здесь она смогла реализовать свою мечту – заниматься чем-то однозначно полезным и правильным.

— Я очень хотела работать в биоинформатике, потому что это самое достойное применение data science. Ведь мы занимаемся лечением и улучшением жизни людей, а не просто помогаем какой-то компании стать богаче, — объясняет Мария. — Сейчас мы работаем над лекарством от рака. В нашем достаточно трудном мире приятно делать работу, которая спасет жизни. Я считаю, что даже если наш проект не окажется успешным, это позволит другим командам приблизиться к решению проблем. Хотя бы потому, что им не придется повторять наши ошибки.

Израильское исследование, в котором участвует Мария, — это часть международного проекта под названием CAR T-REX. Название проекта обыгрывает англоязычное наименование динозавра Tyrannosaurus rex и медицинской технологии CAR-T. Ее сейчас применяют для борьбы против некоторых видов лейкозов и лимфом. То есть — против видов рака, атакующих кроветворную и иммунную системы.

Суть технологии в том, чтобы взять один из видов белых кровяных телец больного  – Т-клетки — и перепрограммировать их так, чтобы они атаковали опухоль.

Теоретически, то же лечение можно было бы применять не только против рака крови, но и против обычных опухолей. Но развитию технологии мешает, что переделанные Т-клетки плохо выживают в микроокружении опухоли. Кроме того, сама CAR-T опасна для пациентов. Применяют ее только тогда, когда ничто другое уже не помогает. Решению этих двух проблем и посвящен международный проект, в котором участвует Мария Дьякова.

«Наша задача —  сделать модифицированные Т-клетки более долгоживущими и более безопасными для пациентов. Одна из причин опасности – сам метод редактирования генов CRISPR Помимо вставок нужных генов в нужном месте, может сделать дополнительные вставки в разных других участках генома. И мы разрабатываем более безопасный аналог», — рассказывает Мария.

Ее нынешние израильские коллеги изначально искали биоинформатика. То есть, человека, умеющего пользоваться уже существующими программными инструментами в биомедицинских целях. Но, попав в проект, репатриантка решила применить data science и теперь обучает искусственный интеллект, который помогает в исследовании.

Например, мы знаем какие вещества производятся внутри иммунной клетки, работающей хорошо, а какие – внутри работающей плохо. Проанализировав много данных о том и другом, программа поможет выявить признаки здоровой и ослабленной клеток и подсказать решение.

Или, к примеру, другая задача. При редактировании генома новый ген надо куда-то вставить. И мест, куда именно его можно вставить, довольно много. Как выбрать подходящий участок? Раньше просто экспериментировали: редактировали геном в разных местах, получали новые клетки, проверяли результаты.

Но нейросеть может просто проанализировать множество разных случаев и подсказать совсем небольшое число потенциально работающих вариантов.

С приходом такого специалиста работа пошла быстрее. Проект рассчитан на 4 года, а длится уже полтора. И 80% задач за это время уже удалось выполнить.

«Легкого пути нет»

Мария родом из Магнитогорска, уральского города, известного своим металлургическим комбинатом. В 2008 году она стала там чуть ли не первым человеком, занимающимся data science. Это сейчас нейросети у всех на слуху, а тогда очень многие считали их тупиковым направлением искусственного интеллекта и всячески отговаривали молодую сотрудницу.

В итоге она обучила программу для распознания дефектов на поверхности металла. Потом занималась прогнозированием спроса у крупных продавцов детской одежды. Но мечтала о биоинформатике. И поступила в соответствующую аспирантуру в МФТИ в подмосковном Долгопрудном.

Атмосфера в России становилась все хуже. Так что план был таков: сдать выпускные в 2022 году, дождаться, пока сын закончит первый класс, и репатриироваться. Начало большой войны заставило пересмотреть планы.

Семья быстро собралась и прилетела в Израиль уже в начале марта 2022 года. А через пару месяцев мама и сестра мужа прибыли по процедуре экстренной репатриации. Поселились, как и многие новые репатрианты, в Нетании. И потом пожалели – работа мечты нашлась в Реховоте.

У мужа более широкая специальность в IT, и он быстро устроился в местном стартапе. А вот Марии потребовался почти год, потому что ее профессия — редкая. Она отправила более 200 резюме, пока в начале 2023 года ее не пригласил на собеседование нынешней работодатель.

— Мне потом сказали, что рассматривали примерно 50 кандидатов, но у меня был самый релевантный опыт. Во время учебы в МФТИ я много работала над нейросетями, связанными с взаимодействием с РНК. Я делала проекты для московского Центра исследований мозга и Института цитологии РАН в Санкт-Петербурге, — объясняет репатриантка. — Я знаю людей моего уровня, которые до сих пор не смогли найти работу в Израиле. Мне повезло, что я еще и биоинформатик.

Гарвард по выходным

Она и сейчас делает проекты на аутсорсе. Это практически хобби. Например, Мария сейчас помогает Школе медицины Гарвардского университета.

— Я беру уже готовые алгоритмы, которые умеют распознавать, к примеру, людей или автомобили. И учу их различать разные типы клеток в микроскопе, — рассказывает Мария. — В данном случае речь идет о клетках почек, но программу можно будет дообучить для другого типа клеток. Этот инструмент облегчает жизнь ученым, потому что раньше они размечали клетки вручную.

Денег за работу израильтянка не получает. Но ее обещают рекомендации и роль соавтора в научных работах.

«Я занимаюсь я этим на выходных., по полдня. Пишу код и получаю удовольствие от процесса и результата, — рассказывает Мария. — Основной работодатель не возражает, при условии, что я не буду заниматься в других местах иммунитетом, раком и редактированием генома.»

Сотрудничество с Гарвардом началось 4 месяца назад. И ни разу она не столкнулась с антисемитизмом и критикой Израиля. Куда оскорбительнее то, что пишут и говорят российские знакомые.

«Были неприятные разговоры с разными, даже близкими людьми. Были те, что попрекали: Россия вам столько дала. А вы ее предали. Уехали в Израиль из-за войны, а он ведет себя еще хуже, чем Россия. Если это не совсем близкие родственники, мы просто перестаем с такими общаться», — признается репатриантка.

Она уже неплохо освоила иврит. Планирует жить здесь и получать третью степень по биоинформатике. Рада, что сына хорошо приняли в школе.

«Для меня Израиль – это прежде всего, уникальное место с переплетением культур, — рассуждает Мария. — Я наслаждаюсь тем, что мои коллеги – это люди, которые знают по несколько языков. Что это люди, чьи родители, бабушки и дедушки приехали из разных уголков мира. Для меня эта страна – какой-то кусочек глобального мира, очень приятно быть его частью».

Никита Аронов, «Детали». Фото: Никита Аронов